Predsednika sindikata izvoli kongres sindikata.
Predsednik sindikata ima naslednje pristojnosti:
– zastopa in predstavlja sindikat,
– je zakoniti zastopnik in podpisnik poslovnega računa sindikata,
– sklicuje in vodi seje sveta sindikata in predsedstva sindikata,
– podpisuje statut in druge spolšne akte sindikata,
– skrbi za zakonitost in dosledno spoštovanje statuta in drugih splošnih aktov ter odločitev organov sindikata,
– skrbi za realizacijo sklepov organov sindikata,
– zastopa sindikat pri sklepanju pravnih poslov,
– razpolaga s sredstvi v skladu z določili splošnih aktov in sklepi organov sindikata,
– v skladu s pooblastili, ki mu jih daje predsedstvo, podpisuje kolektivne pogodbe,
– predlaga kandidate za zaposlitev v sindikatu,
– usklajuje delo območnih odborov ter daje smernice in navodila za njihovo delo,
– določa število in uporabo štampiljk,
– na podlagi statuta in Pravilnika o izvedbi volitev in imenovanj v organe Sindikata železniškega transporta Slovenije sprejema sklep o razpisu volitev in
– opravlja druge naloge v skladu s statutom in drugimi splošnimi akti in sklepi organov sindikata.